Glossary
Hieronder treft u een overzicht van moeilijke woorden en begrippen die je kunt tegenkomen in de bioinformatica en genomics.
Acetylcholine receptor
Een eiwit die in het celmembraan zit en verantwoordelijk is voor de binding van de neurotransmitter acetylcholine.Alignment
Twee aminozuurvolgorden met elkaar vergelijkenArabidopsis thaliana
Zandraket, een modelorganisme voor planten waarvan het genoom bekend isΒ-barrel
Een grote β-sheet die gedraaid, als een tunnel, vaak door het celmembraan steektB-BLAST
Basic Local Alignment Search Tool vindt regio's die gelijk zijn tussen sequentiesC. elegans
Een soort worm, een modelorganisme waarvan het genoom bekend isCladogram
Een cladogram is een afstammingsboom. Het is een figuur waarin je kunt zien hoe verwant sommige dieren of planten onderling zijn.E. coli
Een bacterie die wordt gebruikt als modelorganisme waarvan het genoom bekend isEMBL
European Molecular Biology Laboratory is Europa's grootste laboratorium voor basis onderzoek in moleculaire biologieEndohydrolyse
Het splitsen van chemische verbindingen onder opneming van water binnen een molecuulLipasen
Vet splitsende enzymen die vetten splitsen in glycerine en vetzurenMaize
Maïs is een model organisme voor planten. Het hele genoom is gesequenced. Het bestaat uit 10 grote chromosomenparen die makkelijk bestudeerd kunnen worden onder de microscoopMimulus
Een model organisme voor planten die veel wordt gebruikt in evolutionaire en functionele genoom studiesmiRNA
Een volgorde van niet-coderend RNA van 20 tot 25 nucleotiden lang wat onderdeel is van de epigenetische mechanismen die de expressie van genen regulerenMisc RNA
Soort RNA wat bijvoorbeeld kan deel uit maken van verschillende ribonucleaire eiwit complexenModelorganismen
Organismen waarvan het genoom bekend is. Bijvoorbeeld de mens, chimpansee, koe, muis, rat, zebravis, C. elegans, E. coli en arabidopsis. Als u iets wilt weten over een eiwit, kunt u het best informatie over dat eiwit halen uit een modelorganisme, omdat daar het meest over bekend isMonosachariden
De eenvoudigste vorm van koolhydratenMRS
Een zoekmachine voor biologische en medische databankenMyoglobine
Een zuurstofbindend eiwit dat in grote hoeveelheden voorkomt in de spierenNucleolus
Het deel van de celkern van een eukaryoot waar het DNA het meest gecondenseerd isOligosachariden
Koolhydraten die zijn opgebouwd uit een klein aantal (3-9) monosacharide-eenhedenOMIM
Online Mendelian Inheritance in Man, een databank van menselijke genen en genetische defectenOpen reading frame
Volgorde van basen die begint met een startcodon en die daarna over een lang traject een aaneensluiting van tripletten geeft die elk voor zich coderen voor een aminozuur en die niet door een stopcodon wordt onderbrokenPDB
Protein Data Base. Een databank waarin eiwitten zijn opgeslagen. Bestanden in deze databank zijn pdb-bestanden. Deze kunnen worden gelezen door het programma Yasara.Phylogenetic tree
Een grafische manier om relaties van een groep organismen weer te gevenPhysomitrella patens
Een mos die gebruikt wordt als model organisme en die steeds vaker gebruikt wordt bij studies over de ontwikkeling en moleculaire evolutie van plantenPolymeer
Een molecuul dat bestaat uit een sequentie van meerdere identieke of soortgelijke delen die aan elkaar zijn gekoppeldPolysachariden
Koolhydraten die zijn opgebouwd uit een groot aantal monosacharide-eenheden. Zetmeel is bijvoorbeeld een polysacharidePseudogenes
Disfunctionele verwanten van bekende genen die hun eiwitcoderende vermogen hebben verloren of niet meer tot expressie komen in de celRice
Rijst. Wordt gebruikt als model organisme voor graansoorten . Het heeft een van de kleinste genomen van alle graansoorten en het hele genoom is gesequencedrRNA
Ribosomaal RNA, een speciaal RNA-molecuul dat belangrijk is voor de eiwitsynthesesnoRNA
Een klasse van kort enkelstrengs RNA-materiaal dat zich in de nucleolus bevindtsnRNA
Kleine RNA moleculen die zich bevinden in de nucleus van eukariotische cellenSwiss-Prot
Een databank van hoge kwaliteit voor het opzoeken van eiwit-informatieTitine
Titine is het grootste eiwit in ons lichaam en functioneert als een moleculaire veer die verantwoordelijk is voor de passieve elasticiteit van de spierenUniprot KB
De UniProt Knowledgebase bevat een verzameling van functionele informatie over eiwittenYasara
Een computerprogamma waarmee je de 3D structuur van eiwitten kunt bekijkenX-ray diffractie
Een techniek om de structuur van vaste stoffen te bepalen. Deze techniek wordt gebruikt om de werkelijke structuur van een eiwit te metenStaat jouw woord of begrip er niet tussen? Kijk eens in de (Engelse) wikipedia van de afdeling bioinformatica van het UMC St. Radboud. Of vraag het ons, dan kunnen wij hem toevoegen aan deze lijst.