Tegengif ontwerpen in 3D

Het practicum Tegengif ontwerpen in 3D gaat over slangengif. Slangengif is een enzym dat collageen (een belangrijk structuureiwit in de organen) kapot knipt. Om het slangengif goed te bekijken, leer je eerst omgaan met een 3D-modellingprogramma Yasara. In een oefen-eiwit kunnen verschillende atoominteracties worden bekeken. Als het oefenen achter de rug is, ben je klaar voor het echte werk. Hoe kun je het slangengif onschadelijk maken?

Deze lesmodule is onderdeel van een groter practicum. Het gehele practicum wordt ingezet als het Reizend DNA-lab Bioinformatica: leven in de computer.
Het lespakket bestaat dan uit de volgende onderdelen:

• Inleidende les - 50 min.
• Moord op het vliegveld - 50 min.
• Tegengif ontwerpen - 50 min.

Ter afsluiting van dit complete lespakket bieden wij binnenkort verschillende afsluitende lessen aan. Deze komen zo spoedig mogelijk online te staan.

Benodigde materialen

• Tegengif ontwerpen:Leerlingenhandleiding - .doc (0,4 MB)
• Bioinformatica: Leven in de computer: Leerlingenhandleiding - .doc (0,4 MB)
• Yasara view - gratis te downloaden na registratie op de website
• Yasara-files:
  alle Yasara files in 1 zipbestand - .zip (4,5 MB)- Kopieer de complete mappen naar Yasara
  slangengif - .pdb (0,1 MB) - Kopieer deze file naar de map pdb in Yasara
  slangengif2 - .pdb (0,1 MB) - Kopieer deze file naar de map pdb in Yasara
  oefeneiwit - .sce (0,2 MB) - Kopieer deze file naar de map sce in Yasara
  tegengif alleen koolstof - .sce (0,2 MB) - Kopieer deze file naar de map sce in Yasara
  tegengif versie 1 - .sce (0,2 MB) - Kopieer deze file naar de map sce in Yasara
  tegengif versie 2 - .sce (0,2 MB) - Kopieer deze file naar de map sce in Yasara
  tegengif versie 3 - .sce (0,2 MB) - Kopieer deze file naar de map sce in Yasara
  moviebestand 1 - moviebestand 2 - moviebestand 3 - moviebestand 4 - (0,3 MB) - Kopieer deze files naar de map rattlesnake in de map mov in Yasara